长期目标：

　　推进系统科学创新，创建欧亚高端智库

　　十年愿景：

　　(一)以独有特色与功能屹立于中国科技组织之林;

　　(二)建成具有独到观察力和咨询力的智库机构;

　　(三)以系统科学为中心、集成创新为途径、国家应用为目标，形成几个社会影响较大的标杆项目和平台;

　　(四)创建开放、和谐、包容、高效的组织文化，团结和集纳大批优秀的专家学者。

　　三年规划：

　　(一)方向性目标：1.推进系统科学的基础性和应用性研究，形成具有本会特色的科技成果;2.开展以集成创新为主的科学研究与社会活动;3.结合现实需求，提供高端咨询服务，发挥智库作用。

　　(二)运行性目标：1.建设以沙龙为特色的学术论坛，集纳会员智慧，提出对社会发展重大问题的建议报告，为政府部门、企事业单位、各类民间组织和机构以及社会公众提供咨询服务;2.探索自主管理与发展模式，构筑新型运转机制;3.以信息技术为基础，形成网络结构和网络运转的管理格局;4.以“企业家理事会”为桥梁，构建科学技术与市场运作的通道。

　　(三)组织性目标：1.高质量发展会员，增大科教、经济、外交、医疗、企业、军事等领域的会员比例;2.以北京为枢纽，建立上海、广州、成都等地区会员中心，形成全国性会员网络结构;3.建立系统科学与自然控制论研究所，形成具有新型结构与运转体制的民间研究实体等。

　　(四)自身建设性目标：1.探索和试行枢纽-网络式组织结构的运行机制;2.探索与新闻媒体开展合作的模式，扩大社会影响;3.促进理事会和秘书处年轻化。